Forscher von LSTM, arbeitet gemeinsam mit Kollegen vom Wellcome Sanger Institute, Cambridge, und die Big-Data-Institut, University of Oxford, haben ganze Genom-Sequenzierung zu verstehen, copy-number variants (CNVs), die in malaria-Mücken und Ihre Rolle in der Insektizid-Resistenz.
Viele Krankheiten, wie malaria, Zika-und Dengue-Fieber werden durch Mücken übertragen, so dass die Kontrolle der Moskito-Populationen ein Grundstein der Bemühungen um die Bekämpfung dieser Krankheiten. Dies ist in der Regel erreicht durch den Einsatz von Insektiziden, die traditionell stark in der Wirkung. Dr. Eric Lucas, der erste Autor auf einem Papier veröffentlicht in der Zeitschrift Genome Research, erklärt: „malaria-Fälle wurden stark reduziert in den letzten 20 Jahren, vor allem durch verbesserte Vektor-Steuerung. Diese Bemühungen sind jedoch bedroht durch die Entwicklung von Resistenz gegen Insektizide, die in vielen medizinisch-wichtig Moskito-Arten. Um besser zu verstehen, und die Adresse Insektizid-Resistenz, müssen wir verstehen, wie genetische Mutationen, die Sie verursachen, aber nur wenige Mutationen wurden bisher entdeckt.“
Um besser zu verstehen, die Entwicklung des Widerstandes, LSTM zusammen mit Kollegen an der University of Oxford und den Wellcome Sanger Institute sequenzieren der Genome von tausenden von Individuen der wichtigsten malaria-Mücke Anopheles gambiae, aus ganz Sub-Sahara-Afrika als Teil eines Projekts namens Ein. gambiae 1000-Genome-Projekt (Ag1000G).
Eine Art von mutation, die dazu führen könnten erhöhte Insektizid-Resistenz ist der Gewinn von zusätzlichen Kopien von Genen, die helfen, brechen die Insektizid in der Mücke Körper, aber es hat wenig Forschung in solchen copy-number variants (CNVs), die in malaria-Mücken. Für diese Arbeit, die das team verwendet die Ag1000G Daten zu suchen, erhöht in Kopie-Nummer Ein. gambiae und festgestellt, dass CNVs waren viel wahrscheinlicher, in den Genen, die eine Rolle spielen in der Insektizid-Resistenz als im rest des Genoms. „Diese Resistenz-assoziierten CNVs gefunden wurden, die in nahezu jeder population in unserer Studie“, erklärte Dr. Lucas, „und über 90% der Mücken hatte, steigt in Kopie-Anzahl in einigen Populationen. Insgesamt wurden in den fünf genetische Regionen, die bekannt sind im Zusammenhang mit der Entgiftung von Insektiziden in Einem. Gambia, wir fanden insgesamt 44 unterschiedliche CNVs. Die wiederholte Ursprünge der erhöhten copy-number in den gleichen Genen, deuten darauf hin, dass diese Art von mutation ist relativ Häufig und können eine schnelle evolutionäre Reaktion auf das Insektengift für die Mücken.“