Wie die Kartografen die Fertigstellung einer Karte, die Ermittler identifizierten mehrere neue Subtypen der häufigsten kindheit-Krebs—Forschung, die voraussichtlich verbessern wird die Diagnose und Behandlung von Patienten mit hohem Risiko. St. Jude Children ‚ s Research Hospital Wissenschaftler führten die Studie, die erscheint als advance online publication, die heute in der Fachzeitschrift Nature Genetics.
Forscher verwendeten integrierten genomischen Analyse, einschließlich der RNA-Sequenzierung zu definieren, die genomische Landschaft von B-Zell-akute lymphatische Leukämie (B-ALL) in fast 2.000 Kinder und Erwachsene. B-ALL ist die häufigste form ALLER und der häufigste Krebs bei Kindern. B-ALLE bleibt die führende Ursache der pädiatrischen Krebs-Tod.
Forscher identifizierten 23 Subtypen der B-ALL, darunter acht neue Subtypen, die mit unterschiedlichen genomischen und klinischen Charakteristika sowie Ergebnisse. Subtyp-Prävalenz Häufig variiert mit dem Alter. Mehr als 90 Prozent der B-Fälle können jetzt kategorisiert werden vom Subtyp verglichen mit 70 Prozent vor ein paar Jahren.
„B-ALL hat Bemerkenswerte molekulare Vielfalt, die wir und andere haben verwendet, um zu verfeinern, Klassifizierung und treiben die Entwicklung von Präzisions-Medikamente zu verbessern, B-ALL-Behandlung und Ergebnisse,“ sagte entsprechenden Autor Charles Mullighan, das Baby wird von einem, M. D., Mitglied des St. Jude Abteilung für Pathologie. „Ein Teil der Präzisions-Medizin ist eine genaue molekulare Diagnose, die diese Studie liefert, um noch mehr Patienten.“
Ein neuartiger Subtyp-Definition änderung
Änderungen der Transkriptions-Faktor-gen PAX5 definiert zwei neue Subtypen, einschließlich PAX5 P80R, als die ersten lymphatischer Leukämie initiiert durch eine Punkt-mutation. „Während das sekundäre Mutationen notwendig sind und oft mit der kinase-Signaltransduktion, zeigen wir in diesem Punkt-mutation beeinträchtigt die Entwicklung von lymphatischen B-Zellen und fördert die Entwicklung der B-ALL in Mäusen,“ Mullighan sagte.
Die anderen PAX5-Subtyp, PAX5-verändert, definiert wurde durch diverse Veränderungen des Gens, einschließlich der Sequenz Mutationen oder Umlagerungen mit einem 24 andere Gene. Zusammen die PAX5-Subtypen entfielen fast 10 Prozent der bisher nicht-Kategorisierte Fälle von B-ALL.
Die neue Subtypen beinhalten ein hohes Risiko Vielzahl von B-ALL, tritt vor allem bei Erwachsenen. Sie ist definiert durch die Neuordnung der Transkription Faktoren BCL2 mit MYC oder BCL6. „Dieser Subtyp hat eine düstere Diagnose,“ Mullighan sagte. „Die Anerkennung dieser Untertyp-Definition-Umlagerung führen können alternative Therapie für die Patienten.“ Im Gegensatz dazu ist ein Subtyp definiert durch Umlagerung des Gens DUX4 war verbunden mit einer guten Prognose bei Erwachsenen, wie bisher bei Kindern beobachtet.
Tracking-gen-expression
Die Studie zeigte die Fähigkeit der RNA-Sequenzierung zu identifizieren mehrere Arten von genomischer Veränderungen, wobei die Nützlichkeit dieser Technik für die Leukämie-Diagnose, vor allem bei der Gesamt-Genom-Sequenzierung ist nicht verfügbar. Beispiele in dieser Studie enthaltenen chromosomalen rearrangements, was in fusion Gene, gen-Ausdruck-profile und andere änderungen.
„Durch diese Studie, zwei Drittel der bisherigen uncharacterized B-ALL-Patienten eingestuft werden können, in verschiedene Subtypen mit unterschiedlichen genetischen Veränderung von Profilen und klinische Merkmale“, sagte co-Erstautor Zhaohui Gu, Ph. D., ein postdoctoral fellow in der Mullighan Labor. „Das kann erheblich beschleunigen die Entwicklung von maßgeschneiderten Therapien für diese Patienten.
„Wir haben auch festgestellt eine robuste B-ALL-Klassifikation pipeline basiert hauptsächlich auf RNA-Sequenzierungs-Daten, integriert in die klinische Diagnostik von ALLEN,“ Gu sagte.
„Als Kliniker, diese Daten zur Beschreibung der Diversität der Subtypen von B-ALL wird es uns ermöglichen, zu verfeinern unseren prognostischen Fähigkeiten für den einzelnen Patienten, und schließlich führen zu die Entwicklung von neuen zielgerichteten Therapien, die effektiver Behandlung der Leukämie mit weniger Nebenwirkungen,“ sagte der co-Autor Mark Litzow, M. D., professor für Medizin an der Mayo-Klinik und Vorsitzender der Leukämie-Ausschuss, Eastern Cooperative Oncology Group und der American College of Radiology Imaging Network, die dazu beigetragen haben die Studie.
Zusätzliche Subtypen offenbart
Die anderen neu identifizierten Subtypen beinhalten:
- NUTM1 gen-Umlagerung mit verschiedenen partner-Gene, die Forscher glauben, dass Sie anfällig für die Behandlung
- HLF-gen-rearrangement auf mehrere Gene, darunter TCF4 sowie die bisher anerkannten partner TCF3.
- Drei Unterarten, die Freigabe-Muster der gen-expression, ähnlich denen von etablierten B-ALL-Subtypen. Die Einstufung deutet darauf hin, dass die neue Subtypen, ETV6-RUNX1-wie, KMT2A-wie und ZNF384-wie, haben Risiko-profile und Prognosen vergleichbar zu den etablierten Subtyp, für die Sie benannt sind.
- Zusätzliche Subtypen angetrieben durch Sequenz-Mutationen, einschließlich IKZF1 N159Y. Frühere arbeiten von St. Jude und die Children ‚ s Oncology Group TARGET-initiative haben gezeigt, IKZF1 (Ikaros) Mutationen, um eine Markierung von high-risk-B-ALL.